Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF5O00463 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms