Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLIM4O00461 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLIM4O00461 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms