Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DFFAO00273 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DFFAO00273 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DFFAO00273 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms