Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QRK9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QRK9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QRK9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QRK9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms