Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms