Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms