Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPREP23469 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPREP23469 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPREP23469 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPREP23469 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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