Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKN1Q16512 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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