Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PDE7AQ13946 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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