Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC048344.3-201ENST00000605512 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-2Q9BYQ4 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms