Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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FOXD1Q16676 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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FOXD1Q16676 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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FOXD1Q16676 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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FOXD1Q16676 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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FOXD1Q16676 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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FOXD1Q16676 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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FOXD1Q16676 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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