Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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