RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PDCL2-201ENST00000295645 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.53■■■□□ 2.16
PDCL2-201ENST00000295645 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PDCL2-201ENST00000295645 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PDCL2-201ENST00000295645 FOXD1Q16676 465 aa23.37■■□□□ 1.33
PDCL2-201ENST00000295645 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.05■■□□□ 1.28
PDCL2-201ENST00000295645 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.13■■□□□ 1.13
PDCL2-201ENST00000295645 ADRA2BP18089 450 aa22.1■■□□□ 1.13
PDCL2-201ENST00000295645 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PDCL2-201ENST00000295645 MSH5O43196 834 aa21.85■■□□□ 1.09
PDCL2-201ENST00000295645 POTEDQ86YR6 584 aa20.47■□□□□ 0.87
PDCL2-201ENST00000295645 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PDCL2-201ENST00000295645 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.19■□□□□ 0.82
PDCL2-201ENST00000295645 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PDCL2-201ENST00000295645 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.06■□□□□ 0.8
PDCL2-201ENST00000295645 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.78■□□□□ 0.76
PDCL2-201ENST00000295645 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PDCL2-201ENST00000295645 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PDCL2-201ENST00000295645 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PDCL2-201ENST00000295645 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
PDCL2-201ENST00000295645 KCNA4P22459 653 aa19.2■□□□□ 0.66
PDCL2-201ENST00000295645 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.15■□□□□ 0.66
PDCL2-201ENST00000295645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.91■□□□□ 0.62
PDCL2-201ENST00000295645 RNF39Q9H2S5 420 aa18.62■□□□□ 0.57
PDCL2-201ENST00000295645 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
PDCL2-201ENST00000295645 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PDCL2-201ENST00000295645 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PDCL2-201ENST00000295645 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PDCL2-201ENST00000295645 SLC4A2P04920 1241 aa18.23■□□□□ 0.51
PDCL2-201ENST00000295645 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PDCL2-201ENST00000295645 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PDCL2-201ENST00000295645 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PDCL2-201ENST00000295645 APLP2Q06481 763 aa17.93■□□□□ 0.46
PDCL2-201ENST00000295645 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.87■□□□□ 0.45
PDCL2-201ENST00000295645 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PDCL2-201ENST00000295645 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PDCL2-201ENST00000295645 CAPN15O75808 1086 aa17.75■□□□□ 0.43
PDCL2-201ENST00000295645 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PDCL2-201ENST00000295645 ZBTB22O15209 634 aa17.61■□□□□ 0.41
PDCL2-201ENST00000295645 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
PDCL2-201ENST00000295645 DSG3P32926 999 aa17.55■□□□□ 0.4
PDCL2-201ENST00000295645 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.39■□□□□ 0.37
PDCL2-201ENST00000295645 ABCB7O75027 752 aa17.3■□□□□ 0.36
PDCL2-201ENST00000295645 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PDCL2-201ENST00000295645 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.24■□□□□ 0.35
PDCL2-201ENST00000295645 POLA2Q14181 598 aa17.21■□□□□ 0.35
PDCL2-201ENST00000295645 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.2■□□□□ 0.34
PDCL2-201ENST00000295645 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PDCL2-201ENST00000295645 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PDCL2-201ENST00000295645 FBLN2P98095 1184 aa16.74■□□□□ 0.27
PDCL2-201ENST00000295645 OSCARQ8IYS5 282 aa16.58■□□□□ 0.24
PDCL2-201ENST00000295645 AKT1S1Q96B36 256 aa16.53■□□□□ 0.24
PDCL2-201ENST00000295645 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.49■□□□□ 0.23
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE6P0CI01 402 aa16.49■□□□□ 0.23
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.49■□□□□ 0.23
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PDCL2-201ENST00000295645 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PDCL2-201ENST00000295645 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.26■□□□□ 0.19
PDCL2-201ENST00000295645 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.22■□□□□ 0.19
PDCL2-201ENST00000295645 POTEHQ6S545 545 aa16.16■□□□□ 0.18
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PDCL2-201ENST00000295645 PITPNM1O00562 1244 aa16.08■□□□□ 0.16
PDCL2-201ENST00000295645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.04■□□□□ 0.16
PDCL2-201ENST00000295645 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.95■□□□□ 0.14
PDCL2-201ENST00000295645 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PDCL2-201ENST00000295645 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.9■□□□□ 0.14
PDCL2-201ENST00000295645 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.85■□□□□ 0.13
PDCL2-201ENST00000295645 PRR29P0C7W0 189 aa15.82■□□□□ 0.12
PDCL2-201ENST00000295645 PROM2Q8N271 834 aa15.73■□□□□ 0.11
PDCL2-201ENST00000295645 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PDCL2-201ENST00000295645 FKBP8Q14318 412 aa15.62■□□□□ 0.09
PDCL2-201ENST00000295645 CHADLQ6NUI6 762 aa15.54■□□□□ 0.08
PDCL2-201ENST00000295645 HAX1O00165 279 aa15.53■□□□□ 0.08
PDCL2-201ENST00000295645 CREBZFQ9NS37 354 aa15.46■□□□□ 0.07
PDCL2-201ENST00000295645 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PDCL2-201ENST00000295645 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.39■□□□□ 0.05
PDCL2-201ENST00000295645 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PDCL2-201ENST00000295645 PLEKHG5O94827 1062 aa15.34■□□□□ 0.05
PDCL2-201ENST00000295645 FBXO3Q9UK99 471 aa15.34■□□□□ 0.05
PDCL2-201ENST00000295645 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
PDCL2-201ENST00000295645 MIER1Q8N108 512 aa15.27■□□□□ 0.04
PDCL2-201ENST00000295645 EVX2Q03828 476 aa15.25■□□□□ 0.03
PDCL2-201ENST00000295645 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PDCL2-201ENST00000295645 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PDCL2-201ENST00000295645 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.2■□□□□ 0.02
PDCL2-201ENST00000295645 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PDCL2-201ENST00000295645 CLCN6P51797 869 aa15.17■□□□□ 0.02
PDCL2-201ENST00000295645 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDCL2-201ENST00000295645 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.08■□□□□ 0
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PDCL2-201ENST00000295645 GABBR2O75899 941 aa15.03■□□□□ -0
PDCL2-201ENST00000295645 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PDCL2-201ENST00000295645 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PDCL2-201ENST00000295645 NUBP1P53384 320 aa14.89□□□□□ -0.03
PDCL2-201ENST00000295645 KLHL34Q8N239 644 aa14.88□□□□□ -0.03
PDCL2-201ENST00000295645 RASEFQ8IZ41 740 aa14.87□□□□□ -0.03
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.85□□□□□ -0.03
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