Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFX1Q12986 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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