Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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