Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TPRNQ4KMQ1 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TPRNQ4KMQ1 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms