Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM35Q9UPQ4 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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