Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms