Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 TRERF1-203ENST00000372917 3914 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR296-201ENST00000385215 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005588.1-201ENST00000439168 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000532.1-201ENST00000440999 177 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NHSL2-208ENST00000639939 3402 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS1-203ENST00000344089 4340 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms