Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms