Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA2O43364 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA2O43364 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA2O43364 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA2O43364 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA2O43364 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA2O43364 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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HOXA2O43364 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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