Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms