Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms