Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms