Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED5Q9Y3A6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED5Q9Y3A6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED5Q9Y3A6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED5Q9Y3A6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms