Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms