Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms