Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms