Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms