Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms