Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms