Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD7Q9P2D1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms