Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKIRAS1Q9NYS0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS1Q9NYS0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms