Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms