Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms