Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MED17Q9NVC6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MED17Q9NVC6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms