Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECHDC1Q9NTX5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms