Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms