Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms