Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM1Q9NRU3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms