Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms