Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms