Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMMDC1Q9NPL8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms