Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRHQ9HD43 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms