Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms