Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms