Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCC1Q9HA90 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCC1Q9HA90 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms