Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF41Q9H4P4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF41Q9H4P4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms