Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF541Q9H0D2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms