Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms